Туловище и голова хорасанской агамы заметно приплюснуты; основание хвоста также приплюснуто, остальная его часть в поперечном сечении круглая. Щитки верха головы, за исключением некоторых лежащих в надглазничной области, с тупыми ребрышками. Теменной щиток не больше окружающих его щитков.
Носовой щиток округлой или овальной формы и слабо вздут; ноздря занимает его большую часть; сверху она не видна. Верхнегубных щитков 14-16. Барабанная перепонка расположена поверхностно. Сзади барабанной перепонки и по бокам шеи складки кожи, покрытые крупными коническими, шиповатыми чешуями. Чешуя туловища разнородная; вдоль хребта дорожка из пяти- или шестиугольных чешуи с хорошо развитыми ребрышками, переходящими в шипики, особенно хорошо выраженные у взрослых. Чешуя хребта в 2-3 раза мельче верхнехвостовой и значительно крупнее спинно-боковой. Вдоль боков туловища с каждой стороны по 2 продольных ряда бугорков, покрытых увеличенными шиповатыми чешуйками. Горловая и грудная чешуя у взрослых с хорошо развитыми ребрышками, переходящими в небольшой острый шипик; у молодых — с тупыми, малоза-метными ребрышками. Хвостовые чешуи расположены кольцами; каждые 2 кольца образуют один сегмент; верхнехвостовые чешуи с высокими острыми шипами. У взрослых самцов 5- 6 рядов мозолистых чешуи перед клоакальной щелью.